中华预防医学杂志    2017年12期 1998—2012年中国甲型副伤寒沙门菌的区域传播    PDF     文章点击量:119    
中华预防医学杂志2017年12期
中华医学会主办。
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1998—2012年中国甲型副伤寒沙门菌的区域传播
中华预防医学杂志, 2017,51(12)
http://dx.doi.org/10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2017.12.105

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1998—2012年中国甲型副伤寒沙门菌的区域传播
    
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在亚洲,副伤寒的发病率仍然很高。特别是中国,自1998年以来,已成为世界上副伤寒发病率最高的国家,每年的发病率可达0.08/10万~192.5/10万。该研究对中国的甲型副伤寒沙门菌进行了单核苷酸多态性分析,旨在对甲型副伤寒沙门菌的传播模式和基因关系进行探索。该研究首先对20株甲型副伤寒沙门菌的全基因组测序株进行比较基因组学分析研究,初步得到2 000多个SNP位点。之后,对来自全国范围的96株甲型副伤寒沙门菌菌株进行SNP位点的测定,进一步确定了112个对中国甲型副伤寒沙门菌有较好的分辨率的高分辨SNP位点。最后,选择在1998—2012年间中国发病率最高4个省份(广西、贵州、云南和浙江)中分离得到的甲型副伤寒沙门菌菌株,通过全基因组测序的方法对这112个SNP位点进行单核苷酸多态性分析。结果发现,各自省份有其优势克隆群,在中国,甲型副伤寒沙门菌可能是从沿海地区通过人员流动带到云贵高原的。从世界范围来看,中国的甲型副伤寒和南亚以及东南亚地区的菌株具有较近的亲缘关系。该研究通过生物信息学的大数据分析确定了甲型副伤寒沙门菌在中国发病率最高的4个省份的进化和传播模式。并提示了迁徙到中国东南部的人口很可能是对甲型副伤寒沙门菌的传播产生了重要影响。

参考文献